青少年球员的培训工作也是J联盟各俱乐部的重要任务。各个俱乐部都十分注重青少年球员的培养，俱乐部身后的企业愿意出巨资聘请国际知名教练和球员加入联赛，后期又出资将优秀球员送到国外进行锻炼。

几乎所有的J联赛俱乐部都在球队分层中列出6个层次，在顶级球队的下面是U-18、U-15、U-12，按照规定这三个年龄段的梯队是俱乐部必须成立的，最后还有一般选手训练营和地区的业余普及活动。

一般选手训练营的球员每月交费，在得到认可之后，就可以在俱乐部梯队免费训练，甚至获得薪水。为此，各俱乐部不惜花重金打造培训基地。只要是对足球有兴趣的小孩，交纳相关费用都可以来到训练营进行训练，而俱乐部的球员退役后也会到青训营去做青训教练。

在J联盟中，横滨水手算得上是J联赛当中青训工作做得最好的俱乐部，他们围绕本地区的范围招收青少年球员，现在已有大约3500人在这家俱乐部的训练营里进行训练。

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